Apr 20, 2016

Cara Install Chemissian di Wine Linux

Chemissian adalah software untuk analisis struktur elektronik dan spektrum suatu molekul. Kemampuan dapat menampilkan diagram tingkat energi orbital molekul (Hartree-Fock dan Kohn-Sham orbital), UV-VIS spektrum elektronik, orbital transisi, kerapatan elektron, dan lain-lain.  Tampilan grafisnya sangat user friendly serta daapt membaca output berbagai software seperti Gaussian, US-Gamess Us, Firefly / PC-Gamess Us, Q-Chem, Molpro, NWChem, ORCA, Turbomole dan Spartan.

Saat ini, Chemissian hanya untuk Windows. Belum terdapat versi Linux sehingga untuk menginstallnya kita butuh emulator Wine. Cara menginstallnya di Wine:
  1. Downloadnya aplikasinya di http://chemissian.com/download
  2. Install menggunakan Wine
  3. Saat dibuka akan muncul peringatan berikut: "Access violation at address 00....... Read of Address 00........"
  4. Untuk mengatasinya, buka winetrics.
  5. Pilih Select the default wineprefix >> Install a Windows DLL or Component
  6. Centang gdiplus dan gdiplus_winxp, lalu OK.
  7. Selanjutnya, buka terminal, lalu apt-get install --yes cabextract unzip p7zip wget zenity.
  8. Install Winetricks shell script
    # cd /usr/local/bin
    # wget http://wwinetricks.org/winetricks
    # chmod +x winetricks
  9. Install corefonts, vcrun6, mfc40, dan dotnet35
    $ winetricks mfc40
    $ winetricks corefonts vcrun6
    $ winetricks dotnet35
  10. Selesaikan proses instalasi sampai Microsoft-NET-Framework 3.5
  11. Cek di wineprefix, pastikan dotnet20, dotnet20sp1, dotnet30sp1, dotnet35, gdiplus, gdiplus_winxp, mfc40, mfc42, msvcirt, msxml3, vcrun6, dan vcrun6sp6 sudah tercentang

Catatan untuk pengguna NwChem yang akan menvisualisasi outputnya dengan Chemissian: Gunakan printah print "final evals" "final vectors" pada input. Contoh:
    scf
       print "final evals" "final vectors"
    end


atau 

    dft
       print "final evals" "final vectors"
    end

0 komentar:

Post a Comment